利用气体更换或控制的方法对新鲜食用菌进行保鲜与包装，费用较低，适合长途运输，且产品货架寿命较长，效果很好。
控制法：将新鲜食用菌经整理、分级后，装入厚壁塑膜袋中密封，以控制新鲜空气数量，使子实体代谢减缓；进入市场后最好即时贮于低温条件下，其货架寿命亦因品种而异。
真空法：将新鲜食用菌装入复合塑料袋内，抽空密封，保鲜期较长，但经长运进入市场后，最好低温贮藏。
换气法：将新鲜食用菌装入复合塑料袋后，往袋内注入一定数量的氮气后密封，可有效抑制其细胞酶的活性，从而延长保鲜期，但该法需相应的设备及气源，费用稍高，适合规模化生产单位或个人，实行周年化栽培或反季节栽培时，可推广使用该方法。
硅窗法：市场上的"硅窗保鲜袋"可应用于食用菌保鲜贮藏，但也存在费用偏高等问题。
排氧法：将整理后的鲜菇置入容器内，新鲜食用菌较多时可置于特定房间内，充放二氧化碳气体，约15-30小时后，分装塑料袋并密封。