《藤愍荪土榷野先生》主要讲了以下四件事：
藤野先生检查并从头到末地修改“我”刭娆曝蔚抄的讲义。表现了先生认真负责，一丝不苟的工作态度。
藤野先生指出“我”绘的解剖图中的错误。表现了先生热情关心，严格要求的工作作风。
藤野先生为“我”不信鬼神，敢于解剖尸体而感到高兴和放心。表现了先生的正直无私，直挚诚恳的工作精神。
先生向“我”询问，了解中国女人裹脚的情形。表现了先生的探索研究，实事求是的精神。
《藤野先生》的主题思想
作者通过怀念藤野先生，赞扬藤野先生没有民族偏见的伟大性格和正直、热忱、高尚的品质，回顾了自己在日本求学时期探索救国道路和思想转变的过程：
为了祖国的前途和命运，毅然地放弃了跟随生平最敬爱的老师一一藤野先生学习医学，摈弃了科学救国的改良主义道路，改为从事文艺运动以唤醒人民群众起来革命；从而激励自己要永远不忘革命的初衷，决心同封建及帝国主义势力斗争到底。