GCBI pubmed &gene dictionary&GEO样本检索指南

 时间:2024-11-07 00:19:09

几乎所有的医学及生生科学工作者都会用到Pubmed的搜索功能,如何快速搜索文献,搜索基因就是很对人面对的问题了。

工具/原料

想要进行搜索的文献、基因、样本等等。

方法/步骤

1、首先进行文献搜索,输入网址进入GCBIpubmed首页,这里默认的搜索类别是pubmed,那就不用改了。

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2、输入我们要搜索的文献关键词“免疫疾病”,或者其他关键词。搜索结果出来了307014篇相关文献(当然,这个数量是不断更新的)。

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3、这些文献需要进一步筛艽鹤绚趣选才能找到我需要的文献,这里可以进行一些条件筛选。可以按照影响因子/发表日期进行排序,影响因子高鹚兢尖睁的,一般文章质量都是高的,还可以筛选时间,高级功能里,我比较关注这个研究相关的基因和样本,因为我想做一下验证,那么就可以在高级过滤功能里选上这些附加条件。结果得到451篇文献。

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4、打开这篇文献,我可以看到这篇文献的相关基因有四个,分别是TlrTlr、IlIgh-J,有20个GEO样本。

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5、点击基因即可进入基因查询的结果,或者在搜索匡输入基因名称也行。进入基因查询结果页面,我可以看到这个基因的类型,物种等信息。并且查询结果里有显示基因的相关功能、通路、转录本等等信息。右侧的工具栏还有显示基因/疾病/蛋白的词典。

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6、另外,这篇文献有20个样本,那么我想用这个样本苴煜塑桠来做一些研究,一来验证一下这篇文章,二来,也可以做一些新的研究,我觉得这篇文章的作者没有把这个绛纲苘浑样本利用彻底,我可以再利用一下这个样本。样本的结果又GSE编号,以及样本分组、平台、简介等等。最后发送到我的实验室,进行方案设计。

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7、到这里就OVER了,下一步是做方案设计。

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