Graphpad功能强大,除了可以绘制各种图形外水貔藻疽,还能完成多种分析,如显著性分析以及这里即将介绍的IC50值计算。IC50惺绅寨瞀(halfmaximalinhibitoryconcentration)是指被测量的拮抗剂的半抑制浓度。比如某种酶抑制剂对酶的抑制效率,即酶活性被抑制一半时所需要的酶抑制剂的最小浓度。这个浓度是可以用某些软件计算出来,首先你需要设置一系列的浓度梯度,测定在不同浓度抑制剂的作用下酶活性的多少,根据得到的数据,利用Graphpadprism就可以计算出IC50值了。
工具/原料
Graphpadprism
电脑
方法/步骤
1、打开软件,选择左边的“XY”进行表格创建,通常来说都会做重复试验,可以根据你的试验重复次数在对话框中输入相应的数字,如果没有重复,则直接选择“Y”后面的第一个选项,点击“creat”创建表格:
2、在创建的表格中输入相应的数据,第一列是X轴,通常为浓度,group下面为Y轴数值,Y1,Y2,Y3代表每个浓度对应的3个重复试验的酶活性值:
3、如果需要生成图形,则直接点击“graphs”下面的Data1,因为在这个例子中进行了3次重复试验,所以每个数据点是带有标准差的,有些标准差太小,导致看不到误差棒:
4、下面进行IC50值计算,幻踔佐曝返回“Datatables”下面的“Data1”,点击菜单栏“Analyze”谘锔康民→“Transformconcentrations(X)“→”OK“,在弹出的对话框中选择”Transfomtologarithms“→”OK“:
5、这时候横坐标已经转换成了对数形式,曲线也由原来的凹形转换得接近一条直线了:
6、这样的数据转换有利于曲线的拟合,接下来进行数据拟合,从而计算出IC50值。方法为依次点击菜单栏“Analyze”→“Nonlinearregression(curvefit)”进行曲线拟合:
7、在弹出的对话框中选择“Dose-response-inhibition”下面的第二项,点击“OK”显示计算结果,图中圈出来的值即为IC50值,选择公式时需要具体情况具体分析,选择不同的方程进行拟合:
8、对于生成的图片如果你想作为原始记录进行保存,可以选择锞蕈漉栽“File”→“Export”将图片保存,也可以通过“File”→“S锾攒揉敫aveas”将整个计算过程进行保存,下次如果想要重新查看这个数据,只需要打开保存的文件就可以了。到这里呢对于如何用GraphpadPrism计算IC50呢就介绍完毕了。