流式数据处理软件flowjo新手保姆级教程

 时间:2024-10-18 10:25:49

flowjo是一款强大的流式数据分析软件,同时使用比较繁琐,这篇文章详细介绍了flowjo常用做直方图/曲线图的过程。

工具/原料

flowjo10

流式机拷贝的fcs文件

方法/步骤

1、首先打开flowjo,页面显示;保存在电脑里的fcs文件

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2、手动打开添加sample,或者直接将fcs文件拖拽

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3、拖拽完成后,双击Ctrl组的sample,弹出散点图对话框。

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4、选取合适的形状圈出要分析的细胞,小编喜欢不规则图形这个,比较好操控。圈出细胞后,外圈为细胞碎片,可以不分析。

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5、双击圈出的位置,弹出的就是圈出的细胞,舍弃了外圈的细胞碎片。这时候开始分析,选取合适的横坐钿泼兽匿标,例如小编本次分析表柔比星为红光,选取PE。纵坐标选Histogram,直方图的意思撅掏浑锌。修改完横纵坐标后,原来的散点图就变成了直方图。

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6、如果是只分析一个样的话,到这步就可以c艺皱麾酪opy图片啦;如果要分析多个样,那是不是要把每个样都像上述的过程来一遍呢!答案是不用的。这坎睾牢慨便是flowjo的强大之处,一个样分析好了,就可以直接按照相同的设置处理其它样哦。如下图,鼠标拖拽到allsamples,然后其他所有样点开都已经按照Ctrl组的画法圈好了散点,双击圈住的位置就直接得到直方图啦,横纵坐标都不用再调啦。

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7、那么怎么把直方图都组合重叠在一张图里呢?嚼但匙噻首先将图都copy到layout工作台。然后鼠标拖动其中一张图轻轻放到薷蒴塾寒另一张图上,重叠,就可以直接组合了哦!组合完可以看到每个峰代表哪个样,并且可以自主调节颜色。

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8、双击组合图,弹出的框里可以更改到model模式,可以使两个峰高度大致相同(只是为了图更好看点,对数值没有任何更改)。这个对话框还可以更改线的颜色;把legend√取消掉可以将图三的框去掉哦~

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9、如果单纯想要曲线图,可以将填充的颜色去掉,就变成这样啦。好啦,这就是flowjo直方图的基础过程,下期将降解散点图的做法哦

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