miRNA测序(二代)

 时间:2024-11-07 00:24:19

小RNA是一类内源性的具有调控功能的非编码RNA,主要包括miRNA、piRNA和siRNA等;毋队末哎它的功能膈套甘勰主要是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,在发育、病毒防御、造血过程、器官形成、细抱增殖和凋亡等环节起着重要调控作用。小RNA测序目标:1.miRNA长度,茎环结构,miRNA前体加工,靶基因结合位点和预测;2.转录组和小RNA数据的联合分析。

工具/原料

高通量测序平台:Hiseq等

生物信息学分析

方法/步骤

1、技术流程

miRNA测序(二代)

2、生物信息学分析内容1.测序质量分析与统计、评估;2.microRNA,rRNA,tRN钽吟篑瑜A,intron,exon,snRNA,s荏鱿胫协noRNA注释;3.microRNA的表达量差异分析;4.microRNA表达模式聚类分析;5.microRNA保守性分析;6.microRNA与靶基因之间的调控,microRNA靶基因之间的蛋白-蛋白相互作用网络分析;7.靶基因预测;8.新miRNA预测。

3、结果展示1.数据库使用2.版图展示

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4、样本要求总量:〉4µgRNA;浓度:〉50ng/µL

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