R语言ggplot2绘制带误差棒和显著性标记的柱状图

 时间:2024-11-03 04:14:00

R语言已经成为数据科学入门的必修课之一。数据只有直观的以图形的方式展示,才能帮助我们发现其中的规律,R语言以其强大的可视化功能,备受青睐。而柱状图是常用的图形之一,那么如何绘制简单的柱状图呢?如何在图上加上误差棒呢?又如何加显著性标记呢?笔者总结了工作中的经验,希望对大家有帮助!

方法/步骤

1、读入csv格式数据。如果没有安装ggplot2函数包,请轶葜钥汜自行安装(install.packages"ggplot2")。我们要可视化的数据如下。用代码ex<稆糨孝汶;-read.csv(file.choose(),header=T)读入数据:将读入的数据赋给ex对象。这里选择了鼠标操作的方式读入数据,根据自己数据存储的位置,通过路径选择该数据。

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2、查看数据前六行;载入ggplot2包;并绑定绘图所用的字体。

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3、绘图。首先设置柱条的顺序,否则会按照大小(数字型)或先后(字母)顺序绘图。

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4、给x、y轴添加标签并美化。添加误差棒。

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5、设置y轴范围.去掉背景颜色和网格线、沿坐标轴显示直线.

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6、修改坐标轴刻度字体及其大小.

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7、将coord_cartesian(expand=TRUE),这里的expand=FALSE,则柱子贴近x轴显示。

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8、完整的代码:ex<颍骈城茇-data.frame(read.csv(file.choose(),header=T))head(ex)library(ggplot2)#先“绑定”字体,溅局柑氍以便后续修改图形用windowsFonts(myFont=windowsFont("TimesNewRoman"))#######################t=###设置柱条的顺序,否则会按照大小(数字型)或先后(字母)顺序绘图ex$treatment<-factor(ex$treatment,levels=c("CK","HR","AA","PV","HA","HC","CO"))p<-ggplot(ex,aes(x=treatment,y=value))+geom_bar(stat="identity",width=0.5,fill="white",colour="black")###给x、y轴添加标签并美化p1<-p+labs(x="xxxx",y="xxxx")###添加误差棒p2<-p1+geom_errorbar(aes(ymin=value-se,ymax=value+se),width=0.2)###添加显著性标志p3<-p2+geom_text(aes(label=labe,vjust=-3,hjust=0.5))p3###设置y轴范围p4<-p3+ylim(0,16)p4###去掉背景颜色和网格线、沿坐标轴显示直线p5<-p4+theme(panel.grid.major=element_blank(),panel.grid.minor=element_blank(),panel.background=element_blank(),axis.line=element_line(colour="black",size=0.6))p5###修改坐标轴刻度字体及其大小p6<-p5+theme(axis.text.x=element_text(size=15,family="myFont",color="black",face="plain"),axis.text.y=element_text(size=15,family="myFont",color="black",face="plain"),axis.title=element_text(size=15,family="myFont",color="black",vjust=0.5))p7<-p6+coord_cartesian(expand=FALSE)p7##face取值:plain普通,bold加粗,italic斜体,bold.italic斜体加粗;##也可以在element_text()中加上参数vjust=0.5,hjust=0.5,angle=45调整坐标刻度位置

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