来自哈佛大学神经舌哆猢筢学系的助理教授玛莎•赫伯特(MarthaHerbert)曾经讲述了一个经典的自闭症案例。通过核磁共振扫描，赫伯特博份序鳄垴士仔细查看自闭症儿童的脑部状况后发现，自闭症儿童脑部比正常儿童大。来自美国约翰•霍普金斯大学的黛安娜•瓦尔加斯(DianaVargas)博士及其团队跟进了这项研究。他们不仅对已去世的11名自闭症儿童患者尸体进行大脑检测，还检测了活着的自闭症儿童患者的脊髓液。通过对这些因素进行检查和比较，这些患者的脑部像踝关节肿胀一样发炎了！
赫伯特博士对此提出反对意见，她认为正是在这些肠道、免疫和毒素方面问题的相互作用下，大脑才会事故频发，自闭症就是一种能改变大脑功能的系统性代谢紊乱症。人体超过60%的免疫系统位于消化道，一旦这个关键系统失去平衡，免疫系统的扳机就会被触发，炎症便会烧遍全身。然而不幸的是，我们每天都在伤害消化道。我们吃的是低纤维、高糖分且满是抗生素、杀虫剂和激素的食品；我们喝的是酒精和咖啡因；我们服用抗生素、消炎药、激素和类固醇；我们始终处在压力之中；我们暴露在成千上万的环境毒素里……
科学家们正在探寻：为什么自闭症儿童患者体内的汞毒素越来越多？汞毒素对大脑的影响又是什么？为什么这些儿童的免疫功能会出现异常？为什么他们的肠道内膜和脊髓液里会发现麻疹病毒？一次性为婴儿注射9种疫苗的后果如何？这些又是如何触发炎症并引起自闭症的？这些问题促使我们探寻生理、大脑和行为之间的关系。
功能医学是查找病根的医学，运用矩阵问诊和检验检测查找疾病的根源。功能医学认为人体是一个整体，一种疾病是由多种功能变化导致，一种功能变化可以导致多种疾病。自闭症与多种因素都存在一定关系。在患有各种各样精神疾病的儿童——1/6的发展障碍症患者、1/10的注意力缺陷多动障碍症患者、1/150的自闭症患者中，都能发现相同的代谢问题和环境问题。这些只不过是隐藏的代谢紊乱，绝非基因疾病或大脑损伤。每个孩子的状况不同，同一问题会有不同的症状。同时，不同的病因也会导致相同的症状，如自闭症儿童患者常常沉默寡言、行为冷漠，注意力缺陷多动障碍症儿童患者往往也存在同样的行为问题。所以说，“自闭症”可能会有很多种，由不同的原因引发。
功能医学也是祛除病根的医学。运用防、除、补三字方针，综合干预治疗。与其耗尽心力研制那些作用于大脑的抗自闭类药物，不如研究以消炎、排毒、清除过敏原、消解感染、调理肠道为目标的治疗方法，这恰恰就是功能医学的拿手之处。从饮食里移除谷蛋白和酪蛋白，清除人体内的汞毒素和铅毒素；修复肠道，补充维生素B1维生素B叶酸、ω-3脂肪酸、维生素A、维生素D、镁元素、锌元素。治疗身体，修复大脑，这是著名功能医学专家马克•海曼博士推荐的治愈自闭症良方。