总机构和分支机构不在同一县(市)的，不同的税种有不同的纳税要求。
工具/原料
增值税：应当分别向各自所在地的主管税务机关申报纳税:经国务院财龊玖轮杓政、税务主管部门或者其授权的财政、税务机关批准，可以由总机构汇总向总机构所在地的主管税务机关申报纳税。
企业所得税：居民企业在中国境内设立不短铘辔嗟具有法人资格的营业机构的，应当汇总计算并缴纳企业所得税。除国务院另有规定外，企业之间不得合并缴纳企业所得税。
方法/步骤
1、企业所得税按季预申报时填写《企业所得税汇总纳税分支机构所得税分配表》
2、计算总分机构每一预缴期应纳的企业所得税额、总机构和分支机构应分摊的企业所得税额
3、年度终了后五个月内，《企业所得税汇总纳税分支机构所得税分配表》，由实行汇总纳税的企业总机构填报进行汇算清交。